截至2018年末，涡阳县共有卫生机构515个，其中医院18个、卫生院 23个，社区卫生服务中心（站）29个，妇幼保健院（所、站） 1个，疾病预防控制中心1个。卫生技术人员6967人，其中执业（助理）医师1834人，注册护士2551人。医院、卫生院床位5440张。全年诊疗391万人次。村卫生室368个，乡村医生和卫生员1579人，农村有医疗点的村占总村数的100%。参加新型农村合作医疗的人口144.21万人，参合率101%。2019年8月，入选为紧密型县域医共体建设试点县。
